Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDCD1Q15116 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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