Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD1Q15011 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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