Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms