Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ODF1Q14990 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms