Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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