Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FAT1Q14517 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms