Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB1Q14028 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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