Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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