Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
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SHROOM2Q13796 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SHROOM2Q13796 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
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