Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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