Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DNASE1L3Q13609 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNASE1L3Q13609 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms