Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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