Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCIRG1Q13488 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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