Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF5Q13243 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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