Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms