Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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