Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GTF3C1Q12789 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF3C1Q12789 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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