Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RASGEF1BQ0VAM2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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