Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4CQ08493 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms