Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN1BQ07699 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms