Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFF3Q07654 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms