Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3AQ05086 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms