Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNEQ04844 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms