Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL10A1Q03692 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms