Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F1Q01094 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms