Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYBPC1Q00872 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms