Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLTCQ00610 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms