Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TFAMQ00059 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TFAMQ00059 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms