Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGD1P98174 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGD1P98174 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms