Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms