Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms