Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARF3P61204 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARF3P61204 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms