Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB2AP61019 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB2AP61019 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB2AP61019 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB2AP61019 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms