Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME5P56597 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME5P56597 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms