Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP2P56545 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP2P56545 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms