Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP7P55210 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP7P55210 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP7P55210 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP7P55210 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP7P55210 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms