Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELLP55199 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELLP55199 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ELLP55199 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms