Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC12A2P55011 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC12A2P55011 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms