Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms