Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP4P49662 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP4P49662 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP4P49662 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP4P49662 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP4P49662 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP4P49662 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms