Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPIAP49247 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPIAP49247 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms