Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms