Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP8P40818 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP8P40818 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms