Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGAEP38570 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGAEP38570 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms