Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LTBRP36941 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LTBRP36941 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LTBRP36941 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms