Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GPC1P35052 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms