Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ADSSP30520 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ADSSP30520 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ADSSP30520 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ADSSP30520 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ADSSP30520 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ADSSP30520 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ADSSP30520 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms