Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLD1P28340 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms