Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEX2P28328 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX2P28328 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX2P28328 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PEX2P28328 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEX2P28328 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEX2P28328 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEX2P28328 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms