Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO2P25791 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO2P25791 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO2P25791 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO2P25791 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms